Сиквел, не имеющий прямого отношения к оригинальному сюжету. Чёрный Джек пытается узнать причины взрыва, убившего его мать и тяжело ранившего его самого, постепенно раскрывая секреты таинственной преступной организации и проекта «Нуар», в который его отец и другие знаменитые врачи когда-то были вовлечены....
Во время схватки с Аидом в подземном царстве мертвых двенадцать Золотых Святых жертвуют своими жизнями, разрушая стену плача, а также предоставляя Сэйе и его друзьям возможность продвигаться дальше. Айолиа и другие Золотые Святые, которые должны были исчезнуть, возвращаются к жизни на Земле, полной света и красот. Перед компанией возникает вопрос: каким же образом они воскресли, хотя должны быть мертвыми? Пока тайна...
Война между святыми защитниками Афины и звёздным войском Аида только начинается. Тэмма, понимая, что враг устроил на него охоту, и это и дальше будет ставить под удар окружающих, отправляется прямиком в монастырь, ставший логовом Преисподней. Вместе с ним отправились Юдзуриха и Ято, и, конечно, за ними приглядывают Саша и золотые святые. Алон всё так же изолирован ото всех, запертый Пандорой по приказу...
Со времен древних мифов каждые 200 лет происходит священная война между Афиной и Аидом за земли и человечество. История начинается в Италии XVIII века, где трое сирот, Тенма, Алон и Саша, до недавнего времени были не разлей вода и радовались жизни вместе. Но Сашу забрали в новую семью, и через некоторое время по стечению обстоятельств Тенма уходит, чтобы стать святым рыцарем, обещая вернуться к Алону, когда это...
...
...
Прошло три года после возвращения «Ямато» с планеты Искандер. Земляне вернули свою планету с Космореверс и подписали мирный договор с Гамилусом. В дополнение был разработан новый оборонный флот, который включает в себя передовой броненосец «Андромеда». Несмотря на просьбы Старши, Земля идёт по пути военной экспансии. «Ямато» помогает достичь «мира», но его цена забирает слишком много жизней. Тем временем богиня...
2199 год. Инопланетная раса гамилусиан, чья военная мощь в разы превышает силы человеческой цивилизации, нападает на Землю. После обстрела поверхность планеты становится непригодной для жизни, люди уходят под землю, но рано или поздно радиация доберется и туда. Последней надеждой на спасение становится космический линкор Ямато, отправившийся к дружественной землянам расе за технологией Космореверса, которая поможет...