После героических действий Сайто в войне с Альбионом, Сайто и Луиза возвращаются в Тристейн. Однако там их поджидают очередные неприятности — руны Гандальфа на руке Сайто исчезают, и теперь они с Луизой больше не являются мастером и фамильяром. Борясь с очередным кризисом в своих отношениях, они отправляются на поиски эльфа, обладающего силой возвращать умерших к жизни, и который может знать причину того, почему...
Второй сезон рассказывает о событиях, происходящих через некоторое время после окончания войны. Отношения Луизы и Сайто начинают понемногу налаживаться, ведь она знает, что ради неё Сайто отказался от своей единственной возможности вернуться назад в Токио. И в то время как Луиза начинает использовать загадочную Магию Пустоты из тайной книги, которую ей дала Её Величество Принцесса Генриетта, перед королевством...
2031-й год. Люди наслаждаются процветающим существованием, пока на Землю не вторгаются странные формы жизни, называемые «хардинами». Они начинают активно размножаться и нападать на человеческое население. В качестве контрмеры для исследования хардианов и защиты от них человечество организует «N.I.D.F.». Ведущая учёная этой организации, Юно Рукина, изучившая древние скрижали с предсказанием последней битвы...
...
История о трёх сёстрах. Старшая — Минами Харука, учащаяся во втором классе старшей школы, средняя — Минами Кана, учащаяся во втором классе средней школы, и младшая — Минами Тиаки, учащаяся в пятом классе начальной школы. Девушки живут одни, поэтому полагаются только на себя, помогают друг другу во всём: от реакции на признание в любви до готовки. Сёстры Минами — это милая и весёлая история о жизни девочек....
...
Чтобы окончательно одобрили проект центра научных исследований в коричневой провинции, Шурэй необходимо получить письменные одобрения от всех губернаторов, ведомств, имперского совета и торговой гильдии. Но пока она была в столице, на отдаленной территории коричневой провинции вспыхивает эпидемия неизвестной болезни, а появившаяся банда распускает слухи о том, что в возникновении этой болезни виновата новая...
В данных сериях показаны основные события «Инициал Ди: Стадия четвёртая», а также две новых гонки, которые не были показаны в оригинальном сериале....