Спустя два года после событий первого сезона Дэн и его друзья наслаждаются тихой и спокойной жизнью. Внезапно перед Дэном открывается портал, из которого прибывает Драго. Драго просит своего напарника помочь ему спасти Новую Вестрою от захвативших его родину вестов. Прибыв на Новую Вестрою, Дэн и последовавший за ним Маручо встречают бойцов Фронта Освобождения Бакуган: бойца Сабтерры Миру, бойца Даркуса Эйса и бойца...

Однажды с неба на землю посыпались карты, которые достались детям по всему миру. В этих картах находились монстры разных стихий и способностей. Вскоре шестеро главных героев придумали игру под названием «Бакуган», а потом дополнили её правилами. Вдобавок они назвали свою команду «Отчаянные бойцы бакуган». В один прекрасный день, когда все были поглощены игрой, в неё вступил неизвестный игрок Маска и при помощи...

Когда Юси Инаба учился в первом классе средней школы, у него умерли родители. Его приютила семья родственников. И хотя те искренне заботились о нем, он чувствовал, что его присутствие — бремя для них. Поэтому, когда пришла пора поступать в старшую школу, он выбрал ту, в которой было общежитие. Однако он даже переехать не успел, как здание общежития сгорело. Возвращаться к родственникам он решительно не хотел. Однако...