Год 0079 Вселенского Века. Человечество в связи с перенаселенностью Земли вынуждено эмигрировать на космические колонии, называемые Стороны. Сторона-3, провозгласив себя суверенным Герцогством Зион, объявляет войну Земной Федерации. В то же время Амуро Рэй обнаруживает Гандам, секретное оружие Земной Федерации, способное изменить исход войны. С этих пор Амуро и экипаж крейсера «Белая база» должны противостоять Зиону...