В Токио 2039 года, через десятилетие после охватившего страну вируса, прозванного позже «Апокалипсис», всё находится под контролем мультинациональной организации GHQ, проводящей опыты в области генной инженерии. Сю Ома — обычный школьник в переходном возрасте, с людьми не особо ладит, хотя мечтает завести друзей и перестать быть таким неудачником. Однажды он встречает Инори, участвующую в группе сопротивления...